Les principaux ennemis sont les oiseaux (francolin : oiseau proche de la perdrix) et les souris ou rats. Juste après le semis, il faut poser des appâts autour et à l'intérieur de la parcelle. Par ailleurs, pendant la maturation des grains, on peut utiliser des épouvantails dans le champ pour faire peur aux oiseaux. On peut également procéder à la chasse dans le champ avec le lance-pierre. Les producteurs qui ont de moyens utilisent des filets japonais qui constituent aussi un piège pour les oiseaux. La chasse se fait tôt le matin et dans l'après-midi jusqu'à la tombée de la nuit.
Les insectes aussi peuvent créer des dégâts importants dans la rizière, en attaquant soit la tige, ou les panicules ou même les feuilles. C'est pourquoi il faut être très attentif pour détecter les moindres symptômes et voir s'il y a lieu d'agir en utilisant les insecticides recommandés au Bénin. Il est toujours conseillé que le producteur se réfère au conseiller agricole de sa localité pour décider de l'opportunité ou non de la lutte chimique contre les ennemis ; le riz étant à consommer, il faut éviter au maximum d'utiliser des insecticides lorsque les grains sont déjà formés.
